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了解我们的老算法
综合要素分析:挑选并验证了超200个要素
常用密码子频率表
Dr.Liu’slaboratoryatHar亚博的官网地址dUniversity;KoblanWLetal.2018.Improvingcytidineandadeninebaseeditorsbyexpressionoptimizationandancestralreconstruction.NatureBiotechnology
案例展示
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优化的算法:专利维护的群体免疫算法
方法:将野生型和优化后的序列区分克隆至某一表达载体中,颠末WesternBlot来检测在CHO3E7中的蛋白表达情况(表达数据来自三个单独的克隆)。
与市面上提供的其他密码子优化工具相比,GenSmart™CodonOptimization更方便获取,界面更友好。统统的关键要素都已经整合进算法,只需填写基本的信息(比如序列和宿主),即可完成一键优化。
密码子分析工具
作为举世争先DNA剖析供应商,金斯瑞持续创新,在选拔DNA剖析才干的同时,高兴于引进开端进的算法来优化基因的表达,以称心差异运用的需求。GenSmart™CodonOptimization是基于我们当前开拓并在多个国家和地区经过测试的在线密码子优化工具,可以用于真核生物和原核生物基因表达的优化。
1.金斯瑞案例展示
方法:借助来自差异公司的密码子优化工具,包括金斯瑞(GS),GeneArt(GA),Coller(JC)和IDT,在HEK293中评价基因表达和基因编辑的听从。
目的:评价GenSmart™CodonOptimization工具关于JNK3和GFP蛋白表达的优化选拔。
序列特性化定制:针对每个蛋白的特性中止每个关键要素中止权重设置
结果:在基因表达层面,金斯瑞、GeneArt和Coller的工具表现均优于IDT;在基因编辑层面,金斯瑞工具的表现优于其他工具。
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便捷:免费在线工具,一键优化
2.客户宣布数据
实行GenSmart™密码子优化
特性与优势:
目的:评价差异密码子优化工具优化后的碱基编辑蛋白BE4在基因编辑听从上的影响。
参考文献:
结果:颠末GenSmart™CodonOptimization优化后的GFP和JNK较野生型都有分明的选拔,区分为18和约8倍的选拔。
遗传密码:蛋白质翻译的通用模板
基因剖析效力»
免费在线密码优化工具:一键优化蛋白表达
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综合群体遗传学和免疫学实践,并思索了基因表达的多要素影响,金斯瑞开拓了群体免疫算法--PopulationImmuneAlgorithm(专利号:WO2020024917A1),旨在将两种生物学实践无机结合,辅导蛋白表达的调控,进而优化表达产量和质量。在开拓的历程中,研发小组挑选并验证了超200种基因表达影响要素,包括GC含量、密码子运用频率和RNA酶的剪接位点、RNA动摇反式作用元件。较其他研讨,我们的算法留意思索多要素平衡,以保证给到统统关键要素的权重适合。因此,颠末GenSmart™CodonOptimization的优化,每个基因的优化都是定制化的优化,进而最大化获得具有服从和活动蛋白的机遇。
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